Theo quy chế, Cục Thuế sẽ cung cấp cho Sở GTVT thông tin về các đơn vị được cấp phép kinh doanh vận tải nhưng không thực hiện đăng ký, kê khai và nộp thuế đầy đủ. Cục Thuế cũng sẽ đề nghị Sở GTVT thu hồi giấy phép kinh doanh của những doanh nghiệp nợ thuế bị cưỡng chế hoặc không còn hoạt động.

Ngược lại, Sở GTVT sẽ gửi cho Cục Thuế danh sách các doanh nghiệp, cá nhân được cấp phép kinh doanh vận tải đường bộ, đường thủy và các phương tiện được cấp phù hiệu, biển hiệu. Sở cũng sẽ cung cấp dữ liệu giám sát hành trình xe và phương thức tính cước vận tải khi cơ quan thuế yêu cầu.

Đáng chú ý, Sở GTVT sẽ tạm dừng cấp lại giấy phép kinh doanh và phù hiệu cho các đơn vị nợ thuế quá hạn hoặc gian lận, trốn thuế theo đề xuất của Cục Thuế. Cục Thuế cũng sẽ thông báo cho Sở GTVT về các trường hợp kinh doanh "chui" không có giấy phép để xử lý.

Ngoài ra, quy chế cũng đề cập đến việc kiểm tra chéo để chống thất thu thuế. Theo đó, khi cấp giấy đăng kiểm, Trung tâm Đăng kiểm sẽ kiểm tra việc đóng thuế của chủ phương tiện. Cục Thuế và Sở GTVT có thể thành lập đoàn liên ngành kiểm tra trực tiếp tại trụ sở doanh nghiệp khi cần thiết.

Việc hai cơ quan "bắt tay" quản lý thuế được kỳ vọng sẽ giúp ngăn chặn tình trạng doanh nghiệp vận tải trốn thuế, gian lận thuế hoặc kinh doanh "chui", góp phần bảo đảm nguồn thu cho ngân sách và tạo môi trường cạnh tranh lành mạnh. Đây cũng là một động thái quyết liệt nhằm hiện thực hóa chủ trương siết chặt kỷ cương trong quản lý hoạt động vận tải và xử lý nghiêm các vi phạm pháp luật của ngành giao thông.